มนุษย์ต่างดาวได้มาเยือนโลกในฐานะผู้ลี้ภัยและถูกจำกัดให้อาศัยอยู่ใน 'เขต 9' (District 9) ของแอฟริกาใต้ โดยการควบคุมดูแลตกเป็นหน้าที่ของ 'พหุประชาชาติ' (MNU) องค์กรเอกชนที่มุ่งหวังกำไรจากเทคโนโลยีอาวุธต่างดาว ซึ่งต้องอาศัย DNA ของเอเลี่ยนในการใช้งานเท่านั้น ทว่าเมื่อภารกิจล้มเหลว MNU จึงเริ่มปฏิบัติการกวาดล้างและขับไล่เอเลี่ยนออกจากเขต 9
